Красноярские лесные генетики оптимизируют работу лаборатории

Специалисты отдела мониторинга состояния лесных генетических ресурсов филиала ФБУ «Рослесозащита» - «ЦЗЛ Красноярского края» провели подбор методик, позволяющих оптимизировать работу лаборатории и осуществить переход на реактивы российских производителей в новых экономических реалиях.

Одним из направлений деятельности лесных генетиков является проведение популяционно-генетических исследований, с целью оценки генетического разнообразия и структуры основных лесообразующих пород определенных регионов. При выполнении данных работ, согласно имеющимся утвержденным методикам, обычно используют большое количество образцов, каждый их которых необходимо проанализировать по нескольким признакам. В результате приходится выполнять большое количество анализов для каждого образца.

В настоящий момент наукой разработаны технологии, упрощающие данный процесс и позволяющие одновременно, «в одной пробирке», реализовать исследование образца сразу по нескольким признакам, используя так называемую мультиплексную панель. Это возможность сократить количество реакций, необходимых при тестировании образца, и соответственно сэкономить время и деньги. Значительный потенциал этого метода находит отражение и в быстро растущем количестве публикаций, в которых используется описанный подход.

Однако лишь немногие научные работы посвящены методологическим вопросам и способам улучшения и стандартизации мультиплексных анализов. Существуют значительные различия между предлагаемыми протоколами постановки исследований у разных авторов, даже при условии анализа одинаковых объектов исследования по одним и тем же признакам. Последнее объясняется различными техническими возможностями, качеством исходного материала и конкретными предпочтениями лабораторий в выборе фирм-поставщиков реактивов для молекулярной биологии.

Оптимизация мультиплексных панелей является трудоемкой задачей. Тем не менее, специалистами красноярского отдела лесной генетики подобраны и отработаны два таких аналитических набора для исследования сосны кедровой сибирской с применением появившихся отечественных аналогов реактивов иностранных производителей, которые ничуть не уступают им по качеству и более доступны по цене.
Отработка и внедрение новых методов будут продолжены и послужат совершенствованию производственных процессов лабораторий ДНК-анализа Российского центра защиты леса.